HOLI
An AI-Native Drug Discovery Platform · 2026

Holi

药物研发平台介绍

以基础模型为底座 · 以智能体为研究员
重新定义新药研发的下一个十年
VERSIONProduct Brochure · 2026.1
COVERAGE化药 · 生物药 · 核酸药 · 新模态 · 中药
CLASSIFICATION商业机密 / Confidential
FM PROTEIN.PDB LIGAND.SDF DRUGFM-9B CHAIN-OF-THOUGHT
CHAPTER 01 · CONTEXT
02 / 24
为什么是现在

百年制药业,正在被重写

The pharmaceutical industry stands at an inflection point
ANNO 2026
新药研发产业现状
26亿
USD · AVG R&D COST
单一新药研发的
平均综合成本
12
YEARS · DEVELOPMENT
从靶点发现
到药物上市的周期
9.6%
SUCCESS · PHASE I→APP
临床I期到上市的
整体成功率
90%
FAILURE RATE
临床候选药物
最终失败的比例

三大根本性瓶颈

认知瓶颈 生命系统的复杂性远超人类研究者的认知带宽。一名研究员一生能精读的文献不足十万篇,而生物医药领域每年新增论文超 150 万篇。
实验瓶颈 传统 DMTA 循环以"周"为单位,每个先导化合物需要数千次合成-测试迭代。化学空间 10⁶⁰ 的浩瀚,与实验室年产量数百分子之间存在天文级落差。
转化瓶颈 动物模型与人体的种属差异、临床前数据与临床结局的鸿沟,使大量精心筛选的候选药物在 III 期遭遇"死亡之谷"。
"新药研发不是一个数据问题——它是一个推理问题
而推理,正是当代基础模型的核心能力。"
CHAPTER 02 · PARADIGM SHIFT
03 / 24
范式跃迁

从 AI 辅助工具,到 AI 原生研发

From AI-assisted to AI-native drug discovery
THE GREAT SHIFT
2018 → 2026
LEGACY · 2018-2022

"AI 辅助"
窄AI 流水线范式

  • 每个任务训练一个专门模型
  • 人类研究员手动串联各模块
  • 手工特征工程 / 描述符
  • 判别与生成模型彼此分离
  • 单任务、单模态、单点输出
  • 模型给出标量分数,不给推理
  • 湿实验由人类规划与执行
PARADIGM SHIFT
FRONTIER · 2024-2026

"AI 原生"
基础模型 + 智能体范式

  • 统一多模态基础模型作底座
  • AI Agent 自主规划与决策
  • 原始序列 / 结构 / 文本直接输入
  • 理解与生成在同一模型内完成
  • 跨模态联合推理,零样本泛化
  • 给出推理链、证据、不确定性
  • Agent 直接驱动自动化实验室
Holi,原生构建于第二种范式之上 — A platform born in the era of foundation models.
CHAPTER 03 · ARCHITECTURE
04 / 24
平台总览

四层架构,一体智能

Four-tier architecture · One unified intelligence
SYSTEM
Architecture Overview
04
应用与交互层
Application & Interface
▸ 自然语言研发助手
▸ 项目管理与决策面板
▸ 监管文档自动撰写
▸ 可视化构象与机制浏览
▸ 团队协作与知识沉淀
03
智能体研究员层
Agent Researcher Layer
▸ 靶点发现 Agent
▸ 化学设计 Agent
▸ 生物学 Agent
▸ 临床转化 Agent
▸ 中药复方 Agent
▸ 湿实验 Agent
▸ CSO 总指挥 Agent
02
基础模型底座
Foundation Model Core
▸ DrugFM · 多模态药研基础模型
▸ 蛋白序列-结构-功能
▸ 化学空间生成与理解
▸ 多组学跨模态推理
▸ 中文医药垂直大模型
01
数据与算力基座
Data & Compute Infrastructure
▸ 全域生物医药知识图谱
▸ 自动化湿实验数据回流
▸ 联邦学习与隐私计算
▸ GPU/TPU 异构算力调度
▸ 古籍中医药多模态语料
PART ONE
05 / 24
I
CHAPTER · ONE

基础模型 与
智能体研究员

Foundation Models & Agent Researchers.

平台的核心引擎是自研多模态药研基础模型 DrugFM 与覆盖全研发链条的智能体研究员团队。这是 2024-2026 年生物 AI 领域最深刻的范式变革,也是Holi区别于上一代 AI 制药平台的根本所在。

DrugFM FOUNDATION MODEL CSO总指挥 靶点TARGET 化学CHEM 生物BIO 临床CLIN 中药TCM 湿实验WET-LAB 监管REG
CHAPTER 04 · FOUNDATION MODEL
06 / 24
DrugFM 工作台

指令驱动的多模态推理引擎

Instruction-driven multi-modal reasoning interface
MODULE · 04.01
DrugFM Workbench
platform.holi.ai / drugfm / workbench / project-kras-g12c
⚙ ⌕ ◷ ◉
▸ 活跃项目
KRAS-G12C 抑制剂
Stage · 先导优化 · D45
TNBC 靶点发现
Stage · 早期 · D12
当归四逆汤现代化
Stage · POC · D89
肝靶向 mRNA-X19
Stage · 临床前 · D156
▸ 模型状态
蛋白结构● 在线
分子生成● 在线
ADMET● 在线
核酸 (Evo2)● 在线
TCM-LLM● 推理中
Boltz-2● 在线
▸ 最近会话
设计 KRAS G12C 共价抑制剂...
解析 TROP2 ADC linker 影响
查询 GBM 单细胞数据集
指令模式 · 化学设计 Multi-Modal Chain-of-Thought 2026-05-08 14:32 · ChenY
给我设计 10 个针对 KRAS G12C 的共价抑制剂分子,要求:与 Switch-II 口袋中的 Cys12 形成共价键;logP 在 2-4 之间;分子量 < 500;避开专利 WO2023-117284Sotorasib/Adagrasib 骨架;合成步骤 ≤ 6 步;hERG IC50 > 10μM。
⊙ DRUGFM REASONING · 思维链推理
[Step 1] 加载 KRAS G12C 的 GDP 结合态构象集合(PDB 6OIM, 7C40 + 自有 MD 模拟 1.2μs 样本)...
[Step 2] 识别 Switch-II 口袋的 4 个关键残基:Cys12, His95, Tyr96, Gln99。Cys12 巯基溶剂可及性 SAS = 32.4 Ų。
[Step 3] 检索专利 WO2023-117284 中 32 个核心骨架,建立 Tanimoto < 0.55 的负向约束...
[Step 4] 调用 RFdiffusion-AA + Boltz-2 联合管线,在口袋内生成 1,247 候选 → 共价对接 → ADMET 联合评分 → 输出 Top 10。
推荐
SG-K12C-001
N F
MW 432 · LogP 3.1 · Steps 5
Affinity Kd=2.4nM · hERG >30μM
推荐
SG-K12C-002
N
MW 458 · LogP 2.8 · Steps 4
Affinity Kd=4.1nM · hERG >25μM
候选
SG-K12C-003
MW 411 · LogP 3.4 · Steps 6
Affinity Kd=8.7nM · hERG ~12μM
▸ 本次推理
置信度 87%
基于 6,243 个已知活性配体 + 当前口袋构象集合 + 12 个先导分子的反馈
▸ 性能
Tokens14.2K → 8.3K
耗时2m 47s
GPU 调用H100 × 4
分子筛选1.2M → 10
▸ 调用工具
RFdiffusion-AA Boltz-2 Chai-1 RetroSyn NNP-MD Patent-RAG ADMET-50
▸ 下一步建议
▸ 选择 Top 3 启动委外合成
▸ Free Energy 计算验证
▸ MDM2 选择性预筛
CHAPTER 05 · MULTI-AGENT
07 / 24
Agent 协同工作台

7 × 24 不间断的虚拟科学家团队

A continuous-running team of AI scientists
MODULE · 04.02
Agent Collaboration
platform.holi.ai / agents / orchestrator / live
● LIVE
▸ 智能体团队 · 7 位
CSO 总指挥 ● 编排中
协调 6 位专科 · 当前任务: KRAS-G12C 项目周报
靶点 Agent ● 运行
扫描 158 篇文献 · 生成假说 3 条
化学 Agent ● 思考
优化 SG-K12C-001 选择性
生物学 Agent ● 运行
解读高内涵成像 · 384 孔板
临床 Agent ○ 空闲
等待 IND 任务
中药 Agent ● 思考
解析当归四逆汤 11 味药
湿实验 Agent ● 运行
机器人合成 · 第 23/40 步
⊙ 协作流 · KRAS-G12C 项目
2026-05-08 · 14:32:08
▸ CSO Agent 14:30:12
分解任务:"KRAS-G12C 先导优化" → 化学Agent负责 SAR 与生成;生物Agent负责细胞活性;湿实验Agent负责合成执行。
▸ 化学 Agent 14:31:24
SG-K12C-001 在野生型 KRAS 上有 12% 交叉反应,建议引入 3-氟代吡啶提升 G12C 选择性。已生成 5 个改造分子,提交湿实验 Agent。
▸ 湿实验 Agent 14:31:48
已接收 5 个分子设计。生成 Chemspeed 协议 → 评估合成路线 → 启动 机器人合成 #R3-2026-0508。预计 18 小时完成。
▸ 生物学 Agent 14:32:01
已设计 NCI-H358 (KRAS-G12C+) vs HEK-293 (KRAS-WT) 双细胞活性筛选板。SG-K12C-001 实测 IC50 = 3.2 nM,选择性 SI > 250。
▸ CSO Agent · 综合判断 14:32:08 (now)
SG-K12C-001 性能优秀,已达到先导化合物里程碑。建议 Dr. 陈:(1) 启动小鼠 PK;(2) 推进 cGMP 工艺;(3) 评估 IND-enabling 毒理学路径。
Agent 编排中... 任务队列 23 项 ∞ 持续运行
▸ 任务分解树
◉ KRAS-G12C 先导优化
SAR 分析
选择性预测
5 个新分子合成
├ #R3-001 ✓
├ #R3-002 ⌛ 23/40
└ #R3-005 ◷ 排队
细胞活性筛选
小鼠 PK 设计
毒理学路径评估
▸ 关键决策待审
⚠ 待 PI 审批
是否将 SG-K12C-001 推进到 IND-enabling?

置信度 92% · 评估理由 5 项
PART TWO
08 / 24
II
CHAPTER · TWO

八大研发模块
全链条覆盖

Eight Specialized R&D Modules.

平台覆盖从靶点发现 → 分子设计 → 蛋白工程 → ADMET 评估 → 核酸设计 → 新模态 → 中药复方 → 临床转化的完整研发链路。每个模块均为 DrugFM 基础模型 + 专科 Agent + 真实平台界面的有机整体。

靶点TARGET 化学CHEM 蛋白PROTEIN ADMETSAFETY DrugFM BASE MODEL 核酸RNA/DNA 新模态PROTAC 中药TCM 临床CLIN
MODULE 01 · TARGET DISCOVERY
09 / 24
模块一 · 靶点发现与验证

从文献海洋到靶点假说,端到端推理

Target hypothesis with full evidence chain
CASE · 三阴性乳腺癌
TNBC Target Discovery
platform.holi.ai / target / discovery / TNBC-2026-Q2
● 已分析 · 158 篇文献 · 12 数据集
▸ 检索条件
疾病
三阴性乳腺癌 (TNBC)
ICD-10: C50 · MeSH: D064726
▸ 人群范围
中国女性 东亚 绝经前 BRCA野生型
▸ 数据源
● TCGA-BRCA · 1,098 例
● METABRIC · 1,904 例
● 中国 TNBC 队列 · 612 例
● scRNA-seq · 47 个样本
● 空间转录组 · 12 个样本
● 泛癌蛋白质组 · CPTAC
▸ 模态偏好
▸ 因果推断: do-calculus
▸ 单细胞模型: scGPT
▸ 知识图谱: 1.2B 三元组
⊙ 候选靶点 · 共 23 项 · 已分级
Tier 1 · 强推荐 4 Tier 2 · 推荐 9 Tier 3 · 探索 10
▸ TIER 1 · 强推荐
CDK7 推荐
UniProt: P50613
TNBC 中显著高表达 (FC=4.2, p<0.001),调控转录 elongation。do-calculus 证据等级 A。
可成药性9.2/10
推荐模态: 小分子 · PROTAC
TROP2 推荐
UniProt: P09758
膜蛋白 · 内化效率高。已有 ADC (Trodelvy) 上市验证可成药性。
可成药性9.5/10
推荐模态: ADC · 双抗
DDR1 推荐
UniProt: Q08345
基质受体酪氨酸激酶。中国队列特异性高表达 (vs 欧美 +28%)。
可成药性8.7/10
推荐模态: 小分子
▸ TIER 2 · 推荐
EZH2 候选
P26358 · 表观遗传调控
可成药7.8
PARP1 候选
P09874 · BRCAness 亚群
可成药8.4
USP7 候选
Q93009 · 去泛素化酶
可成药7.2
NTRK1 候选
P04629 · 融合驱动亚群
可成药7.9
▸ TIER 3 · 高新颖性
SLC7A11 探索
铁死亡 · 新颖性 9.1
METTL3 探索
m6A · 新颖性 8.8
CMTM6 探索
PD-L1 稳定子 · 8.4
⊘ 不推荐
MYC
虽相关性强,但难成药 (无口袋)。do-calculus 显示为伴随现象而非驱动因素。
MODULE 02 · MOLECULAR DESIGN
10 / 24
模块二 · 小分子化药设计

口袋约束 3D 生成 + 多目标优化

Pocket-conditioned 3D generation with multi-objective optimization
CASE · KRAS-G12C 共价抑制剂
Lead Optimization
platform.holi.ai / chemistry / design / kras-g12c-d45
⊙ Boltz-2 · RFdiffusion-AA
▸ 设计约束
靶点口袋
KRAS·Switch-II · Cys12
分子量 300 - 500
LogP 2.0 - 4.0
合成步数 ≤ 6 步
专利规避
10 个专利已规避
▸ 多目标
● 活性 · · 选择性
● ADMET · 优化
● 合成可及 ·
● 新颖性 ·
⬢ 蛋白-配体复合物 · Boltz-2 预测
SG-K12C-001 · pTM=0.91
SWITCH-II POCKET Cys12 SH COVALENT N F SG-K12C-001 H-bond His95 Tyr96 Gln99 5 Å
MW
432
LogP
3.1
tPSA
82
hERG
>30
CL_int
12.4
▸ 候选分子 · Top 5
SG-K12C-001 Kd 2.4nM
SG-K12C-002 Kd 4.1nM
SG-K12C-003 Kd 8.7nM
SG-K12C-004 Kd 12.3nM
SG-K12C-005 Kd 23nM
▸ 逆合成路线
5 步合成 · 原料 ¥ 2,840/g
偶氮偶联 → 还原 → Suzuki
→ 脱保护 → 丙烯酰胺化
▸ Agent 建议
▸ 推送湿实验合成 · NCI-H358 测试 · 自由能验证
MODULE 03 · PROTEIN STRUCTURE
11 / 24
模块三 · 蛋白结构与从头设计

AlphaFold 3 + RFdiffusion 级别的蛋白工程

Protein structure prediction & de novo design
CASE · 抗 PD-L1 miniprotein
De Novo Binder Design
platform.holi.ai / protein / design / pdl1-binder-2026
⚙ 已启动 RFdiffusion-AA + ProteinMPNN + ESM3
▸ 设计任务
PD-L1 binder 设计
特异识别 PD-L1 IgV,60aa miniprotein,Kd<10nM,Tm>70°C
▸ 设计方法
RFdiffusion-AA
ProteinMPNN
ESM3 (打分)
Boltz-2 (验证)
▸ 已支持任务
● 单体 / 复合物结构
● 蛋白-小分子 / 核酸
● 构象集合 / 隐性口袋
● 抗体 CDR 设计
● miniprotein binder
● 酶催化设计
⬢ 设计结果 · SG-PDL1-mp-007 · 60 aa
通过验证 pTM 0.94 · ipTM 0.88
PD-L1 · IgV IgV EPITOPE SG-PDL1-mp-007 INTERACTION INTERFACE · 8 H-bonds RFDIFFUSION-AA · PROTEINMPNN · ESM3 VALIDATED
Kd
3.8nM
Tm
82°C
长度
60aa
pTM
0.94
ipTM
0.88
特异性
98%
▸ 设计批次 · 250 候选
pTM × Kd 综合评分分布
SG-007
评分
▸ Top 候选
SG-PDL1-007 9.4
SG-PDL1-023 9.1
SG-PDL1-088 8.9
SG-PDL1-142 8.7
SG-PDL1-201 8.4
▸ 计算耗时 18 min · H100 × 8 · 已推送至湿实验
MODULE 04 · ADMET PROFILING
12 / 24
模块四 · ADMET 与安全性预测

50+ 终点 · 不确定性量化 · 一键评估

50+ endpoints with uncertainty quantification
CASE · 批量评估 24 个候选
SG-K12C 系列
platform.holi.ai / admet / batch / kras-series-eval
● 批量评估完成 · 24/24
⊙ 评估结果矩阵 · 24 分子 × 8 关键终点
分子 ID Caco2 PPB CL_int CYP3A4 hERG AMES DILI
SG-K12C-001 ●●● ●●● ●●● ●●● ●●● ●●● ●●●
SG-K12C-002 ●●● ●●● ●●○ ●●● ●●● ●●● ●●●
SG-K12C-003 ●●● ●●○ ●●● ●●○ ●○○ ●●● ●●○
SG-K12C-004 ●●● ●●● ●●● ●●● ●●○ ●●● ●●●
SG-K12C-005 ●○○ ●●● ●○○ ●●● ●●● ●●● ●●○
SG-K12C-008 ●●● ●●● ●●○ ●●● ●●● ●●● ●●●
SG-K12C-011 ●●○ ●●● ●●● ●○○ ○○○ ●●● ●○○
SG-K12C-014 ●●● ●●● ●●● ●●● ●●○ ●●● ●●●
⌄ 滚动查看其余 16 个分子
●●● 优秀 ●●○ 良好 ●○○ 警示 ○○○ 风险
⊙ SG-K12C-001 · 详细 ADMET 谱
推荐推进
吸收 92% 分布 88% 代谢 89% 排泄 85% 毒性 90% 心安全 87% 综合 ADMET 评分 · 88.5 / 100
▸ 不确定性量化
"模型对 SG-K12C-003 的 hERG 风险预测置信度仅 62%,因含罕见结构片段,建议补充体外实验验证。"
▸ 类器官交叉验证
SG-K12C-001 已通过人源化肝类器官评估,72h 暴露未见显著毒性 (CC50 > 100μM)。
▸ 早期 ADMET 筛选成本降低 90% · 替代约 800 只小鼠实验
MODULE 05 · NUCLEIC ACID
13 / 24
模块五 · 核酸药物设计

基于 Evo 2 级别的生命语言模型

mRNA · siRNA · ASO · Aptamer · CRISPR · Engineering Cas
CASE · 肝靶向 mRNA-X19
Sequence + LNP Co-Design
platform.holi.ai / nucleic / mrna-design / mRNA-X19-liver
⊙ Evo-2 9.3B · 联合 LinearDesign · CodonBERT
≋ mRNA-X19 · 序列优化工作台
编码区 1,287 nt Evo-2 优化 翻译效率 +47%
▸ mRNA 整体架构
m7G cap
7 nt
5' UTR
142 nt
编码区 (CDS) · ATG ... TAA · 1,287 nt
429 aa · 密码子已优化
3' UTR · α-globin
311 nt
poly-A
120
m7G·GGGAAATAAG...[5'UTR]AUGGCGACG·CCG·GCG·CCC·Um1Ψ·CGC·m1ΨUC·Gm5CU·UCC...
m1Ψ = N1-甲基假尿苷 · 96 处替换 ▸ m5C = 5-甲基胞嘧啶 · 24 处替换
▸ 5'UTR 二级结构 · ΔG = -32.4 kcal/mol
4 STEM-LOOPS · IRES MOTIF DETECTED
▸ LNP 配方设计
▸ 可电离脂质SM-102 · 50%
▸ 辅助磷脂DSPC · 10%
▸ 胆固醇· 38.5%
▸ PEG-脂质PEG-DMG · 1.5%
粒径82 nm
PDI0.08
封装率95.4%
肝靶向87% 肝细胞
▸ Evo-2 推理
"原始野生型序列在肝细胞内 24h 翻译效率 1.0×;优化版本 1.47×。

关键改动:CDS 内 GC% 从 48% → 56%;移除 3 个 G-四链体;移除 2 个 IRES-like 弱化点;m1Ψ 替换降低先天免疫激活 87%。"
▸ 关键指标
翻译效率1.47× WT
体内半衰期38 h
免疫原性↓ 87%
密码子调和CAI 0.92
ΔG (5'UTR)-32.4
U-richness优化
▸ 已支持类型
mRNA 疫苗 蛋白替代 siRNA ASO CRISPR sgRNA pegRNA Aptamer circRNA
▸ 国际对标: Inceptive · Moderna AI · Alnylam
▸ 中国队列基因组覆盖
MODULE 06 · NEW MODALITIES
14 / 24
模块六 · 创新疗法

PROTAC · ADC · 双抗 · 复杂模态全栈设计

PROTAC · ADC · Bispecifics · Molecular Glue
CASE · BRD4-PROTAC + TROP2-ADC
Three-body Design
⬢ PROTAC 设计工作台 / protac / brd4-vhl
▸ 三元复合物 · 靶点-Linker-E3
BRD4 TARGET LINKER · 12 atoms · PEG3 VHL E3 LIGASE PROTEIN-PROTEIN INTERFACE STABILIZED DC50 = 4.2 nM · Dmax = 92%
▸ Linker 智能优化
长度12 原子
刚性3 旋转键
极性2 PEG
合成步4 步
▸ E3 连接酶推荐 · 基于组织表达谱
▸ VHL推荐 · 9.2/10
○ CRBN候选 · 8.4/10
○ IAP慎用 · 6.1/10
○ DCAF15新颖 · 7.8/10
▸ 分子胶模式 同步运行分子胶 (molecular glue)设计:诱导邻近,发现非传统 PPI 类降解剂。
⬢ ADC 三元设计 · 抗体偶联药物 / adc / trop2-tnbc
▸ ADC 整体结构 · DAR 控制
Anti-TROP2 IgG1 CLEAVABLE LINKER · MC-Val-Cit-PAB DXd DXd DXd DXd PAYLOAD ×4 · 拓扑异构酶 I 抑制剂 SG-T2-ADC-014 DAR · 4.0 内化效率 · 87% 旁观者效应 ✓ 强 血浆稳定 96 h IC50 · 1.4 nM
▸ 抗体优化
Kd · 0.8 nM
内化 · 87%
种属 · 人/猴 ✓
▸ Payload 选择
类型 · DXd
效价 · pM 级
logD · 2.4
▸ DAR 智能优化 DAR 4.0 在效价血浆稳定性之间最优(基于 1,200 ADC 训练)。
▸ 同时支持 BiTE · DART · KIH · CrossMAb 等双 / 多抗格式
MODULE 07 · TCM AI · I
15 / 24
模块七 · 现代化中药开发 ▸ 国际无对标

从《伤寒论》到分子机制,五层异构图谱

Bridging classical TCM with molecular pharmacology
CASE · 当归四逆汤 · 现代化
Danggui-Sini Decoction
platform.holi.ai / tcm / formula / danggui-sini-tang
❀ TCM-LLM · 中药专属大模型
▸ 当归四逆汤 · 7 味药
当归 君药
Angelica sinensis · 9g · 主导效应通路
桂枝 9g
芍药 9g
细辛 3g
通草 6g
大枣 8 枚
使
炙甘草 6g
使
▸ 解析规模
药材 · 7 · 成分 · 487
靶点 · 218 · 通路 · 42
关联证候 · 12
❀ 复方-成分-靶点-通路-证候 五层异构知识图谱
点击节点查看详情
药材 成分 靶点 通路 证候 当归 桂枝 芍药 细辛 通草 大枣 甘草 藁本内酯 阿魏酸 桂皮醛 芍药苷 + 477 个... COX-2 TRPV1 eNOS VEGFA NF-κB + 213 个... 炎症通路 血管舒张 外周神经 免疫调节 抗氧化 + 37 个... 血虚寒厥证 (原方主证) 雷诺综合征 (现代映射) 化疗周围神经 (新适应症) 糖尿病微血管
7 药材 487 成分 218 靶点 42 通路 12 证候
▸ 古籍 RAG 检索
"手足厥寒,脉细欲绝者,当归四逆汤主之。"
— 《伤寒论》 351 条
▸ TCM Agent 推理
当归·阿魏酸 → eNOS → 血管舒张;桂枝·桂皮醛 → TRPV1 → 末梢温感;细辛 → 神经递质平衡。分子层面解释"温经散寒"之药理。
▸ 肠道菌群三元互作
· 阿魏酸 ←→ Bifidobacterium
· 芍药苷 ←→ Lactobacillus
· 桂皮醛 ↑→ SCFA 合成
12,000 例宏基因组训练
▸ 国际唯一中医药 AI 研发平台
MODULE 07 · TCM AI · II
16 / 24
中药现代化 · 第二部分

道地鉴别 · 智能质控 · 新方设计

Authentication · QC · De Novo Formula Design
CASE · 多组学质控 + 新适应症发现
End-to-End TCM Modernization
⊙ 道地药材鉴别 · 多模态融合 / tcm / authenticity
▸ 待测样本
当归 · 18.4 g
声称: 甘肃岷县 · 当年
▸ AI 鉴定
✓ 道地
置信度: 96.2%
▸ 多模态融合证据
近红外
96.4%
拉曼
94.1%
ESI-MS
97.8%
ITS
99.2%
阿魏酸 0.84% ✓,藁本内酯 1.42% ✓。与岷县基准聚类相似度 0.94(延安 0.72、云南 0.58)。
≋ HPLC 指纹图谱 AI 解读 / tcm / fingerprint
▸ 当归四逆汤水提液 · UPLC-Q-TOF/MS
阿魏酸 藁本内酯 芍药苷 桂皮醛 RT (min) →
峰识别
218
归属
182 · 84%
批次相似
0.96
质控
✓ 合格
⊕ 新方设计 · AI 配伍推荐 / tcm / formula-design
▸ 用户输入
设计针对化疗周围神经病变 (CIPN)的中药新方,避开马兜铃酸类。
▸ TCM Agent · 新方推荐
SG-CIPN-RX-003 · 改良当归四逆汤
当归 12g · 黄芪 15g (新增·益气)
桂枝 9g · 制首乌 9g (新增·养血)
鸡血藤 12g (替细辛·安全 +)
使 炙甘草 6g · 大枣 8 枚
▸ CIPN 缓解 OR=2.8 · 覆盖 47 靶点
⌘ 古方新用 · 适应症发现 / tcm / repositioning
▸ 当归四逆汤 · 新适应症候选
化疗诱导周围神经病变 推荐
证候 0.89 · 通路重叠 73% · 3 篇临床
糖尿病微血管病变 证候 0.78 · 通路 64%
候选
慢性偏头痛 (寒凝型) 证候 0.74 · 通路 58%
候选
原发性痛经 证候 0.71 · 通路 55%
候选
系统性硬化症 (新) 证候 0.66 · 未报道
新颖
MODULE 08 · CLINICAL TRANSLATION
17 / 24
模块八 · 临床前与临床转化

PBPK 外推 · 患者分层 · 合成对照臂

PBPK · Biomarker discovery · Synthetic control arm
CASE · SG-K12C-001 IND-enabling
Clinical Bridge
platform.holi.ai / clinical / translation / SG-K12C-IND
⌘ Tx-LLM · 临床转化大模型
⌘ 人体 PK 外推 · 跨种属
μM 100 10 1 0h 6h 12h 18h 24h Mouse (10 mg/kg) Monkey (3 mg/kg) Human (predicted, 2 mg/kg) 疗效阈值
Cmax
1.4μM
8.4h
F (口服)
62%
DDI 风险
≣ 患者分层 · 响应人群预测
✓ KRAS-G12C+ 且 STK11-WT ORR 预测 65%
○ KRAS-G12C+ 且 KEAP1 突变 ORR 预测 35%
⚠ 既往 KRAS 抑制剂耐药 ORR 预测 12%
⊠ 合成对照臂 · 数字孪生
100% 0% PFS (months) SG-K12C-001 (n=120) 合成对照 (n=120)
数字孪生从 8,420 例 KRAS-G12C+ 历史病例生成 · HR=0.42 · 减少安慰剂组样本量 60%
⌥ 监管文档自动生成
▸ IND 临床方案 (NMPA) ✓ 已生成 · 142 页
▸ 知情同意书 (中/英) ✓ 已生成
▸ Investigator's Brochure ⌛ 生成中 · 87%
▸ eCTD Module 2 (FDA) ⌛ 排队中
▸ 首次人体试验风险评估 ✓ 已生成
内置 FDA · NMPA · EMA · PMDA 模板 · CDISC/SDTM/ADaM 标准
MODULE 09 · SELF-DRIVING LAB
18 / 24
模块九 · 自驱动实验室 (SDL)

Agent 直接驱动机器人,7×24 运转的研究员

Agent-orchestrated robotic lab — DMTAL closed loop
CASE · KRAS-G12C 系列
Closed-Loop Optimization
platform.holi.ai / sdl / live / robot-cluster-shanghai-3
● LIVE · 9 robots · uptime 14d 6h
⊙ DMTAL · 设计-合成-测试-分析-学习闭环
第 7 轮迭代 · 累计 412 次合成 · 1,250 次细胞实验
DMTAL LOOP · ROUND 7 DESIGN 设计 DrugFM Agent MAKE 合成 Chemspeed × 3 TEST 测试 HCS · qPCR ANALYZE 分析 Vision-LLM LEARN 学习 Bayesian Opt ⊙ ITERATION 7 · CONTINUOUS · 412 SAMPLES PROCESSED ▸ 5 个新分子已设计 ▸ 3 个机器人合成中 ▸ 384 孔板测试就绪 ▸ 主动学习算法运行中 ▸ 实验数据 8 GB 回流 ▸ 模型微调 epoch 14/100
▸ 周期
14 天
vs 传统 6-8 周 ↓80%
▸ 成本
¥ 18 万
vs 传统 ¥ 60 万 ↓70%
▸ 信息增益
3.4×
主动学习 vs 网格搜索
▸ 机器人集群 · 上海3号
● Chemspeed-A1 SG-K12C-014 · 23/40
● Chemspeed-A2 SG-K12C-015 · 18/35
● HCS Imager-B 384孔 · 247/384
○ qPCR-C 待命 · 2 小时
+ 5 个机器人 空闲
▸ 主动学习 · 下一批
贝叶斯优化建议下一轮重点测试 3-氟吡啶组炔基末端组,已加入合成队列。
▸ 对标 Berkeley A-Lab · Coscientist · ChemCrow
CHAPTER 06 · COMPETITIVE LANDSCAPE
19 / 24
国际对标分析

与全球顶级 AI 制药平台同处第一阵营

Benchmarking against global frontier AI drug discovery platforms
VS · 2026
Top-Tier Platforms
Holi · 中国 Isomorphic · 英 Recursion · 美 Evo 2 · 美 Schrödinger · 美 A-Lab · 美 Iambic · 美
基础模型 DrugFM (自研 + 集成) AlphaFold 3+ Phenom-2 Evo 2 (9.3B) 无 (经典 FEP) GPT-4 调用 NeuralPLexer
化药 (小分子) ●●● 全栈 ●●● 全栈 ●● 表型驱动 ○ 不支持 ●●● 全栈 ○ 材料化学 ●●● 强
生物药 / 蛋白 ●●● 全栈 ●●● 全栈 ●● 部分 ●● 序列层 ●● 部分 ○ 不支持 ●● 部分
核酸药 ●●● 全栈 (含 Evo-2) ●● 部分 ○ 弱 ●●● 强 (核酸专长) ○ 不支持 ○ 不支持 ○ 弱
PROTAC / ADC ●●● 强 ●● 部分 ●● 部分 ○ 不支持 ●● 部分 ○ 不支持 ●● 部分
现代化中药 ★ ●●●●● 国际唯一 ○ — ○ — ○ — ○ — ○ — ○ —
Agent 协作 ●●● 7-Agent CSO ●● 内部 Agent ●● 部分 ○ 模型层 ○ 工具型 ●●● Agent驱动 ●● 部分
自驱动实验室 ●●● 全闭环 ●● 部分 ●●● 强 (Phenom) ○ 不支持 ○ 不支持 ●●● 标杆 ●● 部分
临床转化 ●●● 全栈 + 中国 ●● Novartis 合作 ●● 部分 ○ 弱 ●● 部分 ○ 不支持 ●● 部分
▸ 核心壁垒 · 中药 AI
国际无对标。基于中文古籍语料、东方人群基因组、本土真实世界数据训练,形成"中国独占技术高地"。
▸ 全栈优势
5 大药物模态 + 7 大研发环节全覆盖,避免国际多数平台的"单点工具碎片化"局限。Agent + SDL 完整闭环。
CHAPTER 07 · VALUE
20 / 24
价值量化

三个数字,重新定义新药经济学

Three numbers that redefine drug economics
QUANTITATIVE
Value Proposition
▸ TIME
−65%
研发周期缩短
从靶点发现到 IND 申报:传统 5-7 年 → 本平台 18-24 个月
▸ AI 原生范式
▸ Agent 7×24 不间断
▸ 自驱动实验室
▸ COST
−75%
研发成本降低
单药研发综合成本:传统 ~$2.6B → 本平台 ~$0.65B
▸ ADMET 早筛省 90%
▸ 替代约 800 只动物
▸ 主动学习省 80% 实验
▸ SUCCESS
3.0×
临床成功率提升
I 期到上市的成功率:传统 9.6% → 本平台 27%+
▸ 患者分层 + 生物标志物
▸ PBPK 跨种属外推
▸ 不确定性量化决策
CHAPTER 08 · DIFFERENTIATION
21 / 24
差异化优势 · 应用场景

五大壁垒,五类客户

Five competitive moats · Five customer segments
FIVE × FIVE
Strategic Advantages

▸ 五大差异化壁垒

01
模态全覆盖
化药 · 生物药 · 核酸 · 新模态 · 中药五大模态全栈,避免单点工具碎片化。
02
中药 AI · 国际独占 ★
古籍 RAG + 五层异构图谱 + 多组学整合,中国独有技术高地,国际无可对标。
03
端到端 Agent 闭环
从靶点到 IND 完整闭环,CSO Agent 智能编排 7 位专科 Agent,自驱动实验室无缝对接。
04
东方人群 · 本土数据
基于华人 / 亚洲人群基因组、本土真实世界临床数据训练,亚太市场天然优势。
05
数据飞轮 · 自我进化
每次实验数据回流触发模型增量训练,平台越用越聪明,形成数据壁垒护城河。

▸ 五类目标客户

大型药企 核心客户
国内 / 国际 Top Pharma 的 AI 转型基础设施,用于其内部研发降本增效与新模态拓展。
Biotech 初创 高增长
为中小型 Biotech 提供"全功能虚拟研发部",按项目订阅,无需自建 AI 团队即可快速推进管线。
CRO / CDMO 扩量
合作研发外包机构嵌入平台能力,为客户提供 AI 增强的发现 + 优化 + 分析全套服务,提升单价与差异化。
中药龙头企业 独占
同仁堂、云南白药等头部中药企业的现代化转型伙伴,为 FDA / EMA 国际注册提供分子机制阐释科学支撑。
学术 / 医院 生态
高校实验室、转化医学中心、医院临床研究中心,借助平台开展学术研究与临床转化合作。
CHAPTER 09 · CASE STUDIES
22 / 24
标杆案例 · 实战验证

五个项目,五种范式突破

Five projects · Five paradigm breakthroughs
REAL-WORLD
Case Studies
CASE 01 · 化药 · 共价抑制剂
D45

KRAS-G12C 共价抑制剂 SG-K12C-001

从靶点确认到先导化合物仅 45 天,规避 10 项国际专利,IC50 达 3.2 nM,对野生型选择性 SI>250。
Boltz-2 RFdiffusion-AA 主动学习 SDL 闭环
CASE 02 · 生物药 · 蛋白工程
已启动毒理

PD-L1 miniprotein SG-PDL1-007

从 250 个 AI 设计候选中筛出 60aa miniprotein,Kd 3.8nM,热稳定 82°C。无糖基化负担,可口服递送。
RFdiffusion ProteinMPNN ESM3
CASE 03 · 中药 · 现代化 ★
D89

当归四逆汤治疗 CIPN 现代化

487 个化学成分映射至 218 个靶点 42 条通路;古方"温经散寒"机制阐释清晰;新适应症化疗周围神经病变(CIPN)已有 3 篇临床报道支持。
五层图谱 古籍 RAG 肠道菌群
CASE 04 · 核酸 · 肝靶向
非人灵长类

肝靶向 mRNA-X19 (家族性高胆固醇)

基于 Evo-2 设计的优化 mRNA 体内翻译效率 +47%,免疫原性 ↓87%。LNP 配方实现 87% 肝细胞特异性递送。
Evo 2 m1Ψ 修饰 SM-102 LNP
CHAPTER 10 · TEAM & ECOSYSTEM
23 / 24
团队 · 生态 · 资质

交叉学科顶尖人才,国际化生态

World-class interdisciplinary team and ecosystem
TEAM
& Ecosystem

▸ 团队构成

▸ AI 算法团队
来自 MIT · Stanford · DeepMind · 字节豆包 · 阿里通义的 AI 研究员,主导 DrugFM 与 Agent 架构。
▸ 药学与化学团队
前默沙东、辉瑞、罗氏、恒瑞、信达的资深药物化学家与生物学家。
▸ 中医药专家组
中国中医科学院、北京中医药大学的院士与教授顾问,主导古籍数字化与中药 AI 设计。
▸ 临床与监管团队
前 FDA 审评员、NMPA 顾问,丰富的 IND / NDA 申报经验。
▸ 全员博士占比 80%

▸ 战略合作

▸ 算力 / 模型
英伟达 H200 集群合作;与开源 ESM·RFdiffusion·Boltz·Evo 团队保持技术同步。
▸ 临床医院
协和、华西、复旦肿瘤、上海交大、北大肿瘤等顶级医院的真实世界数据合作。
▸ 中药企业
与多家上市中药龙头建立战略合作,共同推进经典名方现代化。
▸ 自动化合作
Chemspeed · Hamilton · Molecular Devices 自动化设备生态对接。
▸ 国际国内 50+ 战略伙伴

▸ 合规与资质

FDA 21 CFR Part 11 电子签名合规
NMPA 计算机化系统验证 (CSV)
GLP / GMP / GCP / GVP 体系
ISO 27001 信息安全
个保法 · GDPR 双合规
FDA Predetermined Change Control Plan
CDISC · SDTM · ADaM 标准
联邦学习 · 同态加密 · TEE
▸ 中美双注册 全合规
END · 致谢
24 / 24
HOLI

重新定义新药研发的
下一个十年

Reimagining the next decade of drug discovery —
with foundation models and agent researchers.

⊙ ⊙ ⊙

Thank you · 致 谢

CONTACT platform@holi.ai
WEB www.holi.ai
VERSION 2026.1